22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35180  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  100 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3139  anti-sigma-factor antagonist  86.49 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.287339  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2965  anti-sigma-factor antagonist  78.33 
 
 		 121 aa  170  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.496883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2417  anti-sigma-factor antagonist  66.35 
 
 		 111 aa  143  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  57.26 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  30.77 
 
 		 351 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  37.31 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  30.17 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  41.94 
 
 		 124 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 123 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 115 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>