106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4854 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  224  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  64 
 
 		 114 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  54.72 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  47.12 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  49.09 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  53.27 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  45.63 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  48.89 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  46.07 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  42.16 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  42.16 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  32.63 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.52 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.58 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.18 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  32.56 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  41.38 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  37.5 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 117 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  28.24 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.85 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.61 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.22 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  33.87 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30.68 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.21 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  19.39 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  20.69 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  37.5 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3325  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  31.15 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  31.15 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3387  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.630266  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3336  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481518  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  31.52 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.49 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  37.84 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 113 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 115 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  25 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.76 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  41.82 
 
 		 350 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.26 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  29.76 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.65 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  30.3 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  30.88 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>