90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  100 
 
 		 105 aa  212  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.67 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  34.62 
 
 		 653 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 618 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  28.43 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  31.03 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  23.86 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.89 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.48 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1374  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  29.89 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.74 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  27.72 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  30.59 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.74 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  44.44 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.74 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 		 666 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 1711 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.11 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  28.4 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.07 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.59 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  27.37 
 
 		 429 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.78 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  29.47 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  32.14 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.18 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.04 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.88 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  26.32 
 
 		 131 aa  40  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 113 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>