58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1429 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 131 aa  270  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  51.26 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.54 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.96 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.46 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  32.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.63 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.84 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  34.94 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  24.04 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  28.28 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.63 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  25.25 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.41 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  38.75 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 114 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 113 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 112 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  40.35 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3953  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.72 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  35.29 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  26.32 
 
 		 105 aa  40  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4224  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  25.44 
 
 		 285 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 114 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>