83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3674 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 116 aa  228  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  43.68 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  42.53 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.97 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.56 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  40 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  36.97 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.58 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  38.27 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.53 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.95 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  38.46 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  38.16 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  33.85 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  30.14 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.23 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  25.88 
 
 		 103 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.67 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.18 
 
 		 130 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.99 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  35.94 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.35 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  30.43 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  31.71 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  30.51 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  25 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.85 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 		 157 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.27 
 
 		 121 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>