15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3953 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3953  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 104 aa  196  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4774  anti-sigma-factor antagonist  46.53 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1932  anti-sigma-factor antagonist  42.72 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4422  anti-sigma-factor antagonist  43.96 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0351  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0302265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0361  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0340  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3796  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4520  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  39.44 
 
 		 157 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  38.2 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  41.43 
 
 		 340 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.47 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>