101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3164 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 114 aa  221  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  40.71 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.73 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  29.9 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  32.76 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  33.96 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  33.96 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.63 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  39.58 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  39.6 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  40 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.82 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.5 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  37.38 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.71 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  39.13 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.63 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.96 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  29.73 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.29 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  34.15 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.25 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  31.31 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.66 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.24 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 170 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 115 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.14 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 249 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  28.04 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.04 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>