48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13130  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  39.24 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2419  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31.91 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  28.4 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  36.21 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  36.56 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  32.93 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3863  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.873271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 102 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  36.36 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.68 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 118 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  34.48 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  29.27 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  35.87 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  34.94 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.79 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 116 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>