45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2606 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 128 aa  246  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  30.91 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.65 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  36.11 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  39.81 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  36.45 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  25.96 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.03 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  34.75 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  31.78 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  37.88 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  27.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  21.82 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  30.1 
 
 		 114 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  22.55 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.37 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 114 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>