20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5536 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5155  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5244  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  48.06 
 
 
135 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  43.57 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  41.9 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  41.9 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  43.01 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>