27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0899 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 106 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 106 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 106 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  43.69 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  43.69 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  44.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  44.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  44.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  42.72 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  36.59 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  40.3 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  34.34 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  31.82 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>