26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10527 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  324  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0343  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 
135 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  47.14 
 
 
135 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  37.6 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  37.6 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  37.6 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  36.99 
 
 
135 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
152 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
110 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 
152 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
666 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>