15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0343 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0343  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
135 aa  276  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  81.48 
 
 
135 aa  233  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  54.41 
 
 
151 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  54.41 
 
 
151 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  54.41 
 
 
151 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  45.71 
 
 
158 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>