36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3753 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  29.15 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3450  anti-sigma-factor antagonist  25.91 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.850015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.86 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 		 150 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.62 
 
 		 745 aa  52  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  33.08 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  31.91 
 
 		 771 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  32.85 
 
 		 694 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 122 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.68 
 
 		 728 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  33.09 
 
 		 716 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 		 470 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  31.88 
 
 		 693 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 		 713 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.26 
 
 		 693 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  33.33 
 
 		 122 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 135 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  32.82 
 
 		 805 aa  45.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.16 
 
 		 817 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.01 
 
 		 573 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.71 
 
 		 549 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 750 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10959  hypothetical protein  24.03 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  27.97 
 
 		 591 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.12 
 
 		 952 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  34.88 
 
 		 766 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  34.85 
 
 		 713 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  30.88 
 
 		 743 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  30.53 
 
 		 746 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>