17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03207 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  174  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1752  hypothetical protein  43.62 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1820  hypothetical protein  46.32 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4020  hypothetical protein  56.82 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164835  normal  0.180703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  34.94 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  46.67 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  42.86 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  33.77 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  30.65 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  30.65 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  30.65 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  30.65 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  30.65 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  43.86 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  31.76 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  33.87 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>