16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1895 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  100 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.25 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  36.84 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  37.65 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.57 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  31.11 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.23 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  42.59 
 
 		 103 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  35.62 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  38.37 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.44 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  36.05 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  41.51 
 
 		 101 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>