52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0893 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0893  NTP-binding protein  100 
 
 
94 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.68 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  46.99 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  46.99 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  46.99 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  46.99 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  46.99 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  46.99 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  44.58 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  44.58 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  48.1 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  43.37 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  46.43 
 
 
636 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  45.78 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  43.37 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  42.35 
 
 
115 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  42.35 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  38.46 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.88 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  40 
 
 
103 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  39.08 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  40.26 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  38.82 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  45.12 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  47.54 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  35.16 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  40.24 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.77 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  35.11 
 
 
102 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  45.12 
 
 
91 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  45.12 
 
 
91 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1001  hypothetical protein  36.26 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.92 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  43.9 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0962  toluene-tolerance protein  35.16 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.35 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  41.07 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.83 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.82 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
109 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.23 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  28.57 
 
 
101 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.23 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  37.25 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.04 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.97 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.5 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>