28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0393 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0393  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 
109 aa  221  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00214787  normal  0.11292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  30.11 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  34.18 
 
 
522 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  39.39 
 
 
522 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31.07 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  29.03 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  32.89 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4774  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.75 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 
846 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  28.75 
 
 
108 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.1 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.68 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  30.99 
 
 
517 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3336  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
126 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481518  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3387  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
126 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.630266  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3325  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
126 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>