22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2399 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2399  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  31.36 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  27.96 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0752  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.77 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2760  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.03 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.14 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.35 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  34.72 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  27.14 
 
 		 111 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 127 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>