14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2760 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2760  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 126 aa  253  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  28.21 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2399  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.03 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 101 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  36.07 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  35.48 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>