59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2503 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2503  hypothetical protein  100 
 
 		 2489 aa  4772    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.260274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  25.85 
 
 		 7072 aa  66.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  25.77 
 
 		 4451 aa  65.9  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  44.58 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 677 aa  57  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  43.59 
 
 		 474 aa  56.2  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  50.85 
 
 		 481 aa  56.2  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  52.38 
 
 		 1839 aa  56.2  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  50.85 
 
 		 480 aa  55.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  35.78 
 
 		 6753 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  47.44 
 
 		 475 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  47.44 
 
 		 476 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  54.39 
 
 		 1202 aa  53.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  25.92 
 
 		 2125 aa  53.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  54.1 
 
 		 303 aa  52.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  39.13 
 
 		 901 aa  52.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.22 
 
 		 2239 aa  52.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  45.9 
 
 		 478 aa  51.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  42.59 
 
 		 475 aa  51.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 475 aa  51.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.32 
 
 		 1610 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  44.78 
 
 		 6662 aa  50.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  41.46 
 
 		 504 aa  51.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.78 
 
 		 6683 aa  50.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  44.78 
 
 		 6779 aa  50.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  47.62 
 
 		 553 aa  50.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  39.83 
 
 		 889 aa  50.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.86 
 
 		 1403 aa  50.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  54.55 
 
 		 1883 aa  50.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  40.96 
 
 		 7679 aa  50.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.89 
 
 		 2542 aa  49.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  39.53 
 
 		 874 aa  49.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  34.36 
 
 		 759 aa  49.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  33.94 
 
 		 8682 aa  48.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  40.74 
 
 		 1610 aa  48.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  33.94 
 
 		 9030 aa  49.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  45.45 
 
 		 998 aa  49.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.72 
 
 		 998 aa  49.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  39.74 
 
 		 486 aa  48.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  35.71 
 
 		 4285 aa  48.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  39.73 
 
 		 767 aa  47.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  45.28 
 
 		 5171 aa  48.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.17 
 
 		 2678 aa  47.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  42.2 
 
 		 4678 aa  47.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  34.93 
 
 		 648 aa  47.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.79 
 
 		 2812 aa  47.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  38.74 
 
 		 2704 aa  47.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  39.51 
 
 		 7919 aa  47.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  47.54 
 
 		 2336 aa  47.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.2 
 
 		 4220 aa  47  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  53.57 
 
 		 462 aa  46.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  40 
 
 		 479 aa  47  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  39.53 
 
 		 2133 aa  46.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  46.3 
 
 		 490 aa  46.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  30.03 
 
 		 3333 aa  46.2  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 907 aa  46.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  39.05 
 
 		 559 aa  46.2  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  50 
 
 		 417 aa  45.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  47.37 
 
 		 479 aa  45.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>