More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2554 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  53.47 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  56.16 
 
 		 204 aa  248  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  57.22 
 
 		 199 aa  248  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  46.7 
 
 		 200 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  48.44 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  44 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  45.73 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  44.78 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 		 208 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  42.16 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  44.39 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  44.39 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  44.56 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  44.56 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  44.56 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  43.88 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  40 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  34.58 
 
 		 543 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  34.72 
 
 		 543 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  38.69 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  36.55 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  34.3 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  34.3 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.93 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.347977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  37.19 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.89 
 
 		 558 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  31.31 
 
 		 543 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3447  ABC transporter related  32 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.491828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  35.53 
 
 		 542 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  34.23 
 
 		 268 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  32.65 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0235  ABC transporter related  35.19 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0860423  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  32.86 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3672  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 305 aa  121  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.21 
 
 		 600 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  31.16 
 
 		 545 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.28 
 
 		 332 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  32.27 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  33 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP- binding protein  35.98 
 
 		 320 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  29.72 
 
 		 531 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3572  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 575 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0481418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  30.77 
 
 		 329 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4820  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  33.33 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0235  nickel import ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  33.33 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  33.33 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  33.33 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  31.82 
 
 		 542 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0446  ABC transporter related  29.22 
 
 		 264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.051216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0204  ABC transporter related  35.35 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  32.56 
 
 		 254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  33.33 
 
 		 552 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 		 572 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  32.84 
 
 		 541 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3841  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.88 
 
 		 268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0716  acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase-like protein  34.38 
 
 		 305 aa  115  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.699539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  31.6 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  31.8 
 
 		 540 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 255 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  32.27 
 
 		 532 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  31.34 
 
 		 540 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  35 
 
 		 551 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0439  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 553 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  33.17 
 
 		 540 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.82 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.83 
 
 		 524 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  33.33 
 
 		 377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.17 
 
 		 318 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  31.14 
 
 		 544 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 516 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  31.14 
 
 		 544 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 		 323 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  31.68 
 
 		 337 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.55 
 
 		 317 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2351  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.22 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  33.33 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  29.41 
 
 		 555 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0885  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  28.95 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  30.7 
 
 		 544 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  32.11 
 
 		 265 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  29.73 
 
 		 588 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  33.33 
 
 		 261 aa  111  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 		 547 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7444  ABC transporter, ATP-binding component  35.16 
 
 		 317 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  32.38 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.38 
 
 		 298 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  33.33 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  33.33 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1690  putative ABC transport system ATP-binding protein  31.02 
 
 		 308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.560594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  33.33 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>