More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3070 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  100 
 
 
212 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  43.63 
 
 
209 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  42.65 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  47 
 
 
200 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  48.51 
 
 
200 aa  164  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  40 
 
 
212 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
203 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  40.29 
 
 
199 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  38.35 
 
 
204 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  40.1 
 
 
202 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  31.84 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  38.76 
 
 
205 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  40.5 
 
 
196 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
333 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.787824  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1763  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
333 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  40.18 
 
 
248 aa  131  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
254 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
524 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1885  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  41.46 
 
 
333 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  0.740268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 
600 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375029  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0816  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
346 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  40.96 
 
 
565 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3447  ABC transporter related  40.27 
 
 
282 aa  124  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.491828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  39.22 
 
 
572 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1266  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  38.46 
 
 
311 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  33.18 
 
 
257 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0235  ABC transporter related  36.24 
 
 
227 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0860423  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
708 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.8 
 
 
326 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  38.55 
 
 
198 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
703 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 
320 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.32 
 
 
335 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.517893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  38.54 
 
 
561 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  37.27 
 
 
576 aa  121  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3463  ABC transporter related  44.7 
 
 
546 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.363207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.1 
 
 
325 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.16 
 
 
307 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  34.91 
 
 
571 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 
539 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  38.58 
 
 
582 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.49 
 
 
674 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  32.74 
 
 
543 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  37.14 
 
 
250 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  40.3 
 
 
527 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  44.02 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2866  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  38.57 
 
 
354 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.803051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.87 
 
 
232 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.19 
 
 
313 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.42 
 
 
323 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0835793 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  34.43 
 
 
571 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0179  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.71 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.83 
 
 
347 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1514  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.347977  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3139  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.42 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  38.35 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1333  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.77 
 
 
343 aa  118  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  34.52 
 
 
543 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5646  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.38 
 
 
330 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3117  ABC type ATPase  35.43 
 
 
331 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0682716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0429  ABC transporter related  36.32 
 
 
269 aa  117  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2232  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.09 
 
 
321 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.422704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2624  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
331 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
516 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.16 
 
 
337 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  35.27 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.52 
 
 
323 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
691 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  38.46 
 
 
603 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3544  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 
328 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1657  nickel import ATP-binding protein NikE  32.39 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.24 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
563 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4696  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0347  ABC transporter related  32.52 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  36.82 
 
 
541 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 
332 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0369  ABC peptide transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719925  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  33.49 
 
 
545 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.81 
 
 
568 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  32.57 
 
 
566 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1049  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.74 
 
 
330 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39 
 
 
577 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1297  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.02 
 
 
342 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
607 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  39 
 
 
310 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4734  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 
339 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0446  ABC transporter related  34.8 
 
 
264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.051216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 
332 aa  115  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  38.03 
 
 
559 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5322  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.57 
 
 
339 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2381  ABC transporter related  37.31 
 
 
273 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0184159  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5538  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 
339 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00809075  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  36.41 
 
 
557 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  39.05 
 
 
247 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  38.86 
 
 
337 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000886627  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  38.03 
 
 
559 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>