More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0369 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0369  ABC peptide transporter, ATPase subunit  100 
 
 
277 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  46.69 
 
 
613 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 
454 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  48.95 
 
 
605 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  46.12 
 
 
271 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  53.45 
 
 
573 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
608 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4052  ABC transporter related  45.79 
 
 
612 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0831351  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.37 
 
 
665 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
548 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  43.96 
 
 
575 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.28 
 
 
643 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  50.84 
 
 
551 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  46.01 
 
 
550 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  47.53 
 
 
557 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 
366 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  43.48 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1618  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  43.15 
 
 
322 aa  211  7.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.231064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  44.33 
 
 
549 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  47.53 
 
 
557 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
371 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21107  hitchhiker  0.00198643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  48.28 
 
 
576 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
338 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
360 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384991  normal  0.757279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
355 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
423 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  46.99 
 
 
565 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
339 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  47.29 
 
 
557 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 
547 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.13 
 
 
347 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  48.47 
 
 
543 aa  208  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.62 
 
 
325 aa  208  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2624  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
331 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
594 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.16 
 
 
445 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0943  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
315 aa  207  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  42.86 
 
 
546 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  42.39 
 
 
541 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  50.43 
 
 
600 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  42.8 
 
 
571 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.98 
 
 
326 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0879  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.89 
 
 
436 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
541 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  45.17 
 
 
553 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0775  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  41.3 
 
 
322 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138989  hitchhiker  0.00000000000731431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.79 
 
 
332 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.28 
 
 
575 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  44.4 
 
 
552 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.46 
 
 
333 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  48.94 
 
 
588 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  44.61 
 
 
573 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  46.38 
 
 
619 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 
370 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 
338 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.65 
 
 
321 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  43.45 
 
 
557 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  46.67 
 
 
536 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 
346 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0210  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.55 
 
 
380 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.323945  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  43.63 
 
 
555 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 
336 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  42.21 
 
 
669 aa  205  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  50.87 
 
 
566 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  45.77 
 
 
548 aa  205  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  45.69 
 
 
593 aa  205  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.96 
 
 
674 aa  204  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.08 
 
 
319 aa  204  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  42.91 
 
 
276 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  43.68 
 
 
285 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  43.13 
 
 
307 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 
329 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2853  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
322 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.242382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  41.51 
 
 
542 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 
344 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3302  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
326 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 
344 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 
320 aa  203  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  47.9 
 
 
607 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
329 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  41.92 
 
 
547 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.59 
 
 
329 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5118  putative ABC transporter ATP-binding  42.69 
 
 
325 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583435  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  43.19 
 
 
308 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  43.29 
 
 
308 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_928  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  44.17 
 
 
329 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.536054  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
320 aa  202  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3644  ABC transporter related  45.74 
 
 
265 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.69 
 
 
323 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.54 
 
 
736 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1565  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 
335 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000744963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  47.67 
 
 
516 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  42.59 
 
 
565 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.82 
 
 
333 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.24 
 
 
426 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 
602 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>