More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4052 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  66.02 
 
 		 605 aa  785    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4052  ABC transporter related  100 
 
 		 612 aa  1229    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0831351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  84.38 
 
 		 613 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  83.93 
 
 		 608 aa  1033    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  48.42 
 
 		 577 aa  541  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 620 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.61 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 609 aa  452  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40.23 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  40 
 
 		 627 aa  442  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.26 
 
 		 599 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  41.91 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.95 
 
 		 583 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.85 
 
 		 643 aa  439  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.01 
 
 		 586 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.26 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  41.83 
 
 		 640 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.23 
 
 		 626 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.72 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  41.25 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  43 
 
 		 607 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  39 
 
 		 617 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 		 632 aa  432  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 593 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  42.46 
 
 		 640 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  42.45 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.79 
 
 		 674 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  40.75 
 
 		 610 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 601 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  41.75 
 
 		 624 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  41.23 
 
 		 573 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  39.22 
 
 		 602 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  38.32 
 
 		 564 aa  429  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.91 
 
 		 611 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  39.83 
 
 		 522 aa  428  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  41.64 
 
 		 619 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.48 
 
 		 640 aa  429  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 		 649 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.31 
 
 		 632 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.23 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  40.56 
 
 		 612 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.9 
 
 		 637 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 623 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  38.89 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  41.56 
 
 		 549 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.25 
 
 		 625 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  42.62 
 
 		 609 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 594 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 		 625 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  38.51 
 
 		 647 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  39.32 
 
 		 670 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 		 627 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  40.96 
 
 		 613 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  40.51 
 
 		 712 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.49 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  40.69 
 
 		 623 aa  422  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  41.89 
 
 		 633 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.39 
 
 		 662 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.5 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.42 
 
 		 611 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  39.48 
 
 		 617 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  41.13 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  40.92 
 
 		 611 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  41.76 
 
 		 573 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 601 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 		 703 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 673 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  40.8 
 
 		 576 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  41.79 
 
 		 563 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  41.96 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  39.71 
 
 		 619 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 		 629 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 		 665 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.13 
 
 		 708 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 		 623 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 673 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  41.96 
 
 		 664 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.41 
 
 		 711 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  40.88 
 
 		 629 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.17 
 
 		 662 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  39.48 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1769  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 676 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.14 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 		 676 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.31 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  41.02 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  42.48 
 
 		 562 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.96 
 
 		 633 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  41.06 
 
 		 603 aa  413  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0404  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 679 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 		 677 aa  413  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  41.56 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  41.37 
 
 		 631 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  40.36 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  41.52 
 
 		 658 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 		 623 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>