More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0719 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  69.44 
 
 
605 aa  800    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  81.45 
 
 
613 aa  979    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
608 aa  1225    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4052  ABC transporter related  83.93 
 
 
612 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0831351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  52.41 
 
 
553 aa  572  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  49.25 
 
 
577 aa  549  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.33 
 
 
571 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  41.61 
 
 
620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.43 
 
 
661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 
609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  43.21 
 
 
624 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.28 
 
 
599 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.06 
 
 
643 aa  445  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
541 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  43.17 
 
 
619 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  41.42 
 
 
549 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
623 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.93 
 
 
640 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.29 
 
 
623 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  39.63 
 
 
578 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  39.44 
 
 
627 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  41.27 
 
 
629 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  41.42 
 
 
594 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  41.63 
 
 
583 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  41.1 
 
 
612 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.23 
 
 
572 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.24 
 
 
584 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  41.72 
 
 
610 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  43.24 
 
 
619 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  41.29 
 
 
615 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  42.6 
 
 
566 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  41.88 
 
 
629 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  40.48 
 
 
712 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  42.47 
 
 
593 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.47 
 
 
649 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  38.93 
 
 
522 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.32 
 
 
632 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.4 
 
 
632 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  43.69 
 
 
579 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.65 
 
 
586 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.86 
 
 
626 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  42.11 
 
 
640 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
601 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.58 
 
 
611 aa  429  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  41.53 
 
 
597 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.86 
 
 
611 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.22 
 
 
674 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  42.51 
 
 
640 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.33 
 
 
749 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  37.54 
 
 
564 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 
627 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  39.08 
 
 
602 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  39.27 
 
 
603 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.26 
 
 
615 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.44 
 
 
547 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  38.7 
 
 
617 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  41.69 
 
 
631 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 
703 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  41.19 
 
 
606 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40.07 
 
 
546 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 
633 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  40.67 
 
 
571 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  41.9 
 
 
619 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.25 
 
 
756 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  41.68 
 
 
593 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
607 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 
625 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 
625 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 
637 aa  425  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  42.11 
 
 
633 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
601 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.8 
 
 
619 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  40.37 
 
 
617 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.83 
 
 
575 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  41.26 
 
 
575 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.53 
 
 
629 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 
676 aa  419  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  41.54 
 
 
573 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  39.93 
 
 
573 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  37.67 
 
 
647 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  41.49 
 
 
624 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 
708 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  41.44 
 
 
658 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  40.27 
 
 
576 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 
623 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  42.3 
 
 
664 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 
629 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  41.41 
 
 
686 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  41.06 
 
 
564 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
695 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  42.01 
 
 
609 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  38.98 
 
 
570 aa  419  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
677 aa  416  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 
625 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  40.64 
 
 
599 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.72 
 
 
634 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.4 
 
 
617 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.98 
 
 
634 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0598  ABC transporter related  42.09 
 
 
588 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>