More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5440 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  563  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  76.52 
 
 
285 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  75.76 
 
 
285 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  69.7 
 
 
276 aa  361  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  71.48 
 
 
308 aa  359  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  71.37 
 
 
289 aa  338  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  65.65 
 
 
350 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  57.36 
 
 
282 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 
276 aa  295  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.75 
 
 
282 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.58 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.21 
 
 
334 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  54.02 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  52.87 
 
 
358 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  52.87 
 
 
358 aa  271  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  52.87 
 
 
358 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.21 
 
 
334 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  53.64 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.64 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  53.64 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.64 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.64 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  55.73 
 
 
329 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 
337 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 
337 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 
337 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 
337 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.05 
 
 
366 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.92 
 
 
337 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.46 
 
 
336 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 
342 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  52.63 
 
 
338 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  52.24 
 
 
544 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.36 
 
 
355 aa  265  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.78 
 
 
321 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 
423 aa  265  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  50.88 
 
 
613 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  52.63 
 
 
325 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 
346 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  52.9 
 
 
330 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.08 
 
 
336 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.08 
 
 
339 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  52.22 
 
 
335 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  49.43 
 
 
308 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
308 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.7 
 
 
329 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  52.08 
 
 
337 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
339 aa  262  6e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.08 
 
 
344 aa  261  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50.56 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50.56 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  49.81 
 
 
308 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.84 
 
 
370 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 
346 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.84 
 
 
307 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
308 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5646  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  53.99 
 
 
330 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7775  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.37 
 
 
419 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.65 
 
 
350 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  53.05 
 
 
339 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  49.61 
 
 
282 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.11 
 
 
443 aa  258  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.76 
 
 
337 aa  258  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.12 
 
 
332 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1950  oligopeptide transport ATP-binding protein F  50.19 
 
 
330 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.81 
 
 
349 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 
326 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0598  ABC transporter related  52.94 
 
 
588 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  53.7 
 
 
585 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4408  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.03 
 
 
333 aa  254  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2838  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 
328 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.840124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.36 
 
 
322 aa  254  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.58 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0270  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.58 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2159  oligopeptide transport ATP-binding protein  48.65 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00546678  normal  0.0666705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0252  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  47.67 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3107  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.03 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.170361  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1956  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  48.65 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2066  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.65 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0222  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 
336 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.12 
 
 
338 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0235  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 
336 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 
355 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1694  dipeptide transporter ATP-binding subunit  52.31 
 
 
334 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  49.04 
 
 
275 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0249  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 
321 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 
336 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0209  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
391 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000220082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.94 
 
 
336 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6153  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  51.55 
 
 
342 aa  252  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3054  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.53 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  52.76 
 
 
536 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>