More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1033 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  506  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  47.51 
 
 
207 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.3 
 
 
320 aa  202  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
320 aa  202  5e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1249  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.02 
 
 
320 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2381  ABC transporter related  43.67 
 
 
273 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0184159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  43.56 
 
 
239 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0391  ABC transporter related  43.3 
 
 
257 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.578216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 
315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.758275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0235  ABC transporter related  43.61 
 
 
227 aa  188  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0860423  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  43.36 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  42.62 
 
 
629 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.38 
 
 
328 aa  182  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  40.42 
 
 
282 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1075  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.48 
 
 
319 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0227  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  38.53 
 
 
312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
680 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5354  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.81 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 
540 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  42.8 
 
 
255 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  46.61 
 
 
540 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 
549 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 
549 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 
549 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 
549 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1705  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.76 
 
 
326 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0602  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 
327 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.154872  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  46.61 
 
 
540 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 
465 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  45.45 
 
 
617 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  46.61 
 
 
540 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  45.29 
 
 
540 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 
549 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 
276 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 
549 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 
282 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  42.4 
 
 
627 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  48.8 
 
 
588 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  39.36 
 
 
613 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
349 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1405  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  41.67 
 
 
309 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.67 
 
 
326 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
323 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  46.41 
 
 
539 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.04 
 
 
584 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  43.28 
 
 
600 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 
334 aa  176  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.666215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.08 
 
 
322 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2028  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
236 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.97327  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 
328 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84761  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
338 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 
340 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.98385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
346 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
327 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.08 
 
 
322 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  45.7 
 
 
540 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  45.7 
 
 
540 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.08 
 
 
322 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  40 
 
 
624 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.48 
 
 
444 aa  175  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0310035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.95 
 
 
543 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.08 
 
 
322 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 
544 aa  174  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  40.97 
 
 
319 aa  174  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1901  ABC transporter related  39.26 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  42.04 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.07 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  40.25 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 
557 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 
549 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  45.5 
 
 
544 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  40.44 
 
 
571 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  41.3 
 
 
631 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1020  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113907  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  47.5 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
346 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.07 
 
 
320 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2029  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  40.35 
 
 
319 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  45.89 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2624  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  40.57 
 
 
624 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.24 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  39.45 
 
 
322 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.772702  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  37.87 
 
 
573 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1928  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  37.21 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.89 
 
 
665 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 
695 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  43.28 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  40.6 
 
 
546 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 
329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  40.52 
 
 
555 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>