More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0045 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  423  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  47.51 
 
 
248 aa  204  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 
232 aa  187  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0235  ABC transporter related  47 
 
 
227 aa  187  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0860423  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  42.25 
 
 
547 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
313 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
320 aa  177  8e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.69 
 
 
349 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
551 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  42.72 
 
 
544 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
292 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  42.72 
 
 
544 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0892  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.54 
 
 
328 aa  171  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.915711  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 
320 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 
326 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5112  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
284 aa  169  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0418858  normal  0.958098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3421  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 
369 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  43.9 
 
 
328 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  39.71 
 
 
255 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  43 
 
 
249 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.74 
 
 
313 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
311 aa  168  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.11 
 
 
318 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 
322 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
311 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 
322 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  43.33 
 
 
319 aa  167  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
311 aa  167  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
311 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
311 aa  167  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
311 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
311 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
311 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
311 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 
321 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 
338 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
321 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  43 
 
 
249 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
328 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  42.16 
 
 
370 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.22 
 
 
332 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
326 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
335 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  42 
 
 
350 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  46.46 
 
 
288 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  46.97 
 
 
287 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  43.65 
 
 
282 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 
680 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3644  ABC transporter related  43.84 
 
 
265 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 
322 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 
343 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 
321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  43.94 
 
 
617 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
335 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2601  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
336 aa  165  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
336 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2988  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 
336 aa  165  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.35 
 
 
325 aa  165  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 
347 aa  165  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
323 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
329 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 
366 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
323 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1249  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
320 aa  165  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 
311 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
571 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  41.26 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.63 
 
 
327 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 
388 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
338 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  41.35 
 
 
311 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
327 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  39.91 
 
 
631 aa  164  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 
337 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  44.13 
 
 
588 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
539 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
337 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  42.92 
 
 
543 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  41.15 
 
 
556 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 
326 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0468  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.8 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322598  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  42.79 
 
 
334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 
336 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  40.28 
 
 
573 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  38.77 
 
 
549 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  40.48 
 
 
251 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>