More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3640 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  60.31 
 
 		 196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  40.61 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  43.5 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  45 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  43.02 
 
 		 205 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  42.78 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  39.77 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  38.69 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  38.38 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  39.09 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  39.7 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  38.58 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  38.58 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  38.55 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  39.7 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  39.2 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 516 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0235  ABC transporter related  32.02 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0860423  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.12 
 
 		 618 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  32.54 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.94 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.517893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  33.96 
 
 		 613 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 562 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  35.42 
 
 		 540 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  35.64 
 
 		 594 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5134  putative peptide ABC transporter ATP-binding protein, oppF-like protein  37.97 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  30.62 
 
 		 557 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.85 
 
 		 333 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.787824  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1763  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 		 333 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  35.42 
 
 		 540 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  35.42 
 
 		 540 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.11 
 
 		 328 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  34.74 
 
 		 569 aa  101  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  34.21 
 
 		 566 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.69 
 
 		 231 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0250512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  35.14 
 
 		 582 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  35.6 
 
 		 563 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2866  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  34.38 
 
 		 354 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.23701  normal  0.803051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1975  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 		 285 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  33.51 
 
 		 254 aa  99  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  30.88 
 
 		 539 aa  99.4  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  32.2 
 
 		 233 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  32.2 
 
 		 233 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  32.6 
 
 		 571 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3447  ABC transporter related  33.16 
 
 		 282 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.491828 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0842  ABC transporter related  36.41 
 
 		 593 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0423448 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 486 aa  97.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  35.57 
 
 		 337 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000886627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 		 524 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1885  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  34.38 
 
 		 333 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  0.740268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  32.11 
 
 		 572 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  34.21 
 
 		 547 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  35.33 
 
 		 253 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2528  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.2 
 
 		 335 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  hitchhiker  0.00943552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 486 aa  95.9  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2381  ABC transporter related  35.05 
 
 		 273 aa  95.5  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0184159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  32.18 
 
 		 543 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.03 
 
 		 294 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  33.49 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3346  nickel transporter ATP-binding protein NikE  36.98 
 
 		 273 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  33.51 
 
 		 565 aa  95.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0204  ABC transporter related  35.23 
 
 		 307 aa  95.5  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 530 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  34.17 
 
 		 547 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.79 
 
 		 568 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  30.46 
 
 		 557 aa  95.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.73 
 
 		 337 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  35.23 
 
 		 255 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  32.7 
 
 		 538 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 529 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  29.96 
 
 		 529 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 		 669 aa  94.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 529 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 529 aa  94.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 529 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  32.68 
 
 		 541 aa  94.4  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1514  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  36.65 
 
 		 549 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 529 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  33.33 
 
 		 352 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 230 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 530 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  31.86 
 
 		 631 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  34.18 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1935  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  33.49 
 
 		 359 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299826  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  32.29 
 
 		 354 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.64 
 
 		 341 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.570854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  36.67 
 
 		 478 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  31.58 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.07 
 
 		 323 aa  93.2  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0753  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, ATPase subunit  32.64 
 
 		 348 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>