More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0950 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0250512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  58.44 
 
 
233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  58.44 
 
 
233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  36.44 
 
 
566 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
562 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  36.07 
 
 
569 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  34.41 
 
 
563 aa  161  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  35.62 
 
 
565 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.9 
 
 
326 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.75 
 
 
343 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.752821  normal  0.689608 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  31.33 
 
 
674 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  32.77 
 
 
547 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  36.64 
 
 
277 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  34.68 
 
 
561 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  33.33 
 
 
288 aa  148  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  34.35 
 
 
547 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  33.91 
 
 
559 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  32.46 
 
 
611 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  32.89 
 
 
600 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  33.48 
 
 
555 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  31.3 
 
 
329 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  32.61 
 
 
544 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  32.61 
 
 
544 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3672  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 
305 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  32.02 
 
 
611 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0892  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.74 
 
 
328 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.915711  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0636  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 
322 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.82 
 
 
597 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  32.61 
 
 
544 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.86 
 
 
584 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5586  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.08 
 
 
511 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249808  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  33.03 
 
 
340 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.93 
 
 
329 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.33 
 
 
333 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  30.33 
 
 
613 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2855  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 
332 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847801  normal  0.650854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1017  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
351 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  30.97 
 
 
573 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1672  putative ABC transport system ATP-binding protein  32.09 
 
 
308 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
338 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5788  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 
328 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267087 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6444  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.02 
 
 
330 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.247483 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5658  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.59 
 
 
314 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.02 
 
 
330 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787873 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  30.29 
 
 
550 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 
336 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0613  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
336 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.33 
 
 
318 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.09 
 
 
308 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.09 
 
 
308 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5354  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  32.89 
 
 
324 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2351  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.64 
 
 
315 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1568  putative ABC transport system ATP-binding protein  32.09 
 
 
308 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2812  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.06 
 
 
368 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2095  putative ABC transport system ATP-binding protein  32.09 
 
 
308 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1746  putative ABC transport system ATP-binding protein  32.09 
 
 
308 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.375505  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  31.88 
 
 
608 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  32.94 
 
 
540 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  32.91 
 
 
527 aa  141  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
539 aa  141  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1690  putative ABC transport system ATP-binding protein  32.09 
 
 
308 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.560594  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2366  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
332 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.343189  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  30.58 
 
 
536 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2185  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 
327 aa  141  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01441  D-ala-D-ala transporter subunit  31.63 
 
 
308 aa  141  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.63 
 
 
340 aa  141  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.62904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 
540 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2420  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.06 
 
 
369 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01453  hypothetical protein  31.63 
 
 
308 aa  141  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.113501  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0506  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.63 
 
 
340 aa  141  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  32.89 
 
 
287 aa  141  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  28.97 
 
 
532 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 
337 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  28.89 
 
 
548 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1801  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.76 
 
 
372 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32 
 
 
327 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  32.94 
 
 
540 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  32.94 
 
 
540 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.93 
 
 
321 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  30.25 
 
 
588 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1950  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.53 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003661  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  33.33 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  30.26 
 
 
540 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2381  ABC transporter related  31.85 
 
 
273 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0184159  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3859  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.44 
 
 
343 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0837257  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  32.94 
 
 
540 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  31 
 
 
352 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.788659  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 
276 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  32.94 
 
 
540 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1933  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.25 
 
 
335 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  34.07 
 
 
557 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0397  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 
613 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02945  hypothetical protein  31.56 
 
 
336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  33.33 
 
 
555 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  28.57 
 
 
543 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>