More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1380 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  99.49 
 
 
196 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  98.98 
 
 
196 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  99.49 
 
 
196 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  99.49 
 
 
196 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  61.78 
 
 
221 aa  249  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  61.78 
 
 
221 aa  249  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  61.78 
 
 
221 aa  249  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  42.86 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 
208 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  43.68 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  40.31 
 
 
204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  44.39 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  46.19 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  43.98 
 
 
209 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  41.67 
 
 
205 aa  165  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
207 aa  165  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  41.11 
 
 
202 aa  157  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  40.91 
 
 
200 aa  150  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  42.35 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  38.58 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  36.82 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 
235 aa  112  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  33.85 
 
 
254 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  38.58 
 
 
212 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
230 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.06 
 
 
317 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
516 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  32.64 
 
 
578 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0160  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.02 
 
 
320 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  35.03 
 
 
467 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
669 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1665  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.62 
 
 
325 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  31.25 
 
 
308 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.88 
 
 
323 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  29.28 
 
 
619 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1184  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 
318 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.52 
 
 
298 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2108  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.8 
 
 
600 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167308  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  31.44 
 
 
541 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  33 
 
 
216 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.16 
 
 
289 aa  99.8  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.77 
 
 
516 aa  99  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.85 
 
 
558 aa  99  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  35.6 
 
 
486 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  31.12 
 
 
261 aa  98.6  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  31.63 
 
 
557 aa  98.2  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3447  ABC transporter related  33.85 
 
 
282 aa  98.2  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.491828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  32.28 
 
 
561 aa  97.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  33.85 
 
 
556 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  32.69 
 
 
265 aa  97.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  31.61 
 
 
536 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  30.66 
 
 
543 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0636  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 
322 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  31.09 
 
 
342 aa  96.3  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
486 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2392  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.3 
 
 
350 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.066682  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0749  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.8 
 
 
312 aa  95.9  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.760141  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0756  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.28 
 
 
320 aa  95.9  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.288444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.38 
 
 
600 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375029  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 
454 aa  96.3  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  33.51 
 
 
566 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.53 
 
 
334 aa  95.5  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  31.28 
 
 
311 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  32.06 
 
 
547 aa  95.5  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1192  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.38 
 
 
324 aa  95.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.794758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.22 
 
 
328 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  31.47 
 
 
536 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  30.2 
 
 
611 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.31 
 
 
566 aa  94.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31.28 
 
 
333 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  31.19 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0397  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
325 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01350  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.16 
 
 
286 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6006  ABC transporter related  33.68 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.57 
 
 
336 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  32.81 
 
 
462 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  30.93 
 
 
307 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  29.74 
 
 
539 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1859  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 
328 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  31.94 
 
 
593 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.59 
 
 
337 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1067  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.05 
 
 
385 aa  92.8  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4852  ABC transporter related protein  30.65 
 
 
261 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.059944  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  31.86 
 
 
575 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4212  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  31.08 
 
 
326 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.01 
 
 
318 aa  92.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  33.97 
 
 
532 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 
669 aa  92.8  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.219449  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  33.16 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3344  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.83 
 
 
609 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0586997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  32.99 
 
 
594 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.73 
 
 
320 aa  92  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  31.03 
 
 
239 aa  92.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  31.68 
 
 
311 aa  92.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  32.98 
 
 
545 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>