More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1325 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1325  ATPase  100 
 
 
200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  52.04 
 
 
209 aa  222  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  51.53 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  48.98 
 
 
202 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  45.88 
 
 
207 aa  205  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  49.49 
 
 
199 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.45 
 
 
203 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  45.73 
 
 
212 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
208 aa  201  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  50.51 
 
 
200 aa  197  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  46.67 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  43.59 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  46.19 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
196 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  46.19 
 
 
196 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  45.69 
 
 
196 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  47 
 
 
212 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  45.45 
 
 
221 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
221 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
221 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  42.42 
 
 
196 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  45.37 
 
 
216 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  45 
 
 
198 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
215 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  33.82 
 
 
254 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.347977  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
524 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0369  ABC peptide transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 
277 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719925  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  38.95 
 
 
571 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0885  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  33.64 
 
 
322 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  37.89 
 
 
566 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 
571 aa  121  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0716  acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase-like protein  34.18 
 
 
305 aa  121  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.699539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
571 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  33.66 
 
 
557 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  35.68 
 
 
552 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  35.78 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  37.14 
 
 
255 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
262 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  37.14 
 
 
262 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
262 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
516 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
255 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
255 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
262 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
262 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2108  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 
600 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167308  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  35.47 
 
 
572 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 
326 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3672  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
305 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  35.68 
 
 
552 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.12 
 
 
326 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  36.14 
 
 
265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  34.36 
 
 
555 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  36.71 
 
 
338 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0554278  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.32 
 
 
347 aa  115  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  36.6 
 
 
557 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
454 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1885  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  35.05 
 
 
333 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  0.740268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  36.65 
 
 
582 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0756  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 
320 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.288444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1067  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 
385 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  34.48 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0446  ABC transporter related  33.99 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.051216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 
323 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  35.92 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  36.65 
 
 
592 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  36.65 
 
 
592 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  34.27 
 
 
552 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  33.97 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  33.97 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  33.92 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.63 
 
 
338 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 
332 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 
235 aa  112  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 
388 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
336 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  32.08 
 
 
545 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
609 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.88 
 
 
289 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  36.49 
 
 
565 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  33.83 
 
 
250 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  37.5 
 
 
251 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  36.07 
 
 
576 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.56 
 
 
582 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0204  ABC transporter related  36.7 
 
 
307 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  34.23 
 
 
619 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1763  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 
333 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 
333 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.787824  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.08 
 
 
572 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  36.67 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  36.65 
 
 
565 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  36.98 
 
 
251 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  36.67 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>