More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1129 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  61.78 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  61.78 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  61.78 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  61.78 
 
 		 196 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  61.78 
 
 		 196 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  46.11 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  49.13 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  43.75 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 208 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  44.33 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  43.81 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  44.56 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  44.33 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  42.33 
 
 		 202 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  45.45 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  47.13 
 
 		 196 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  42.78 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  34.11 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  35.12 
 
 		 541 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  33.33 
 
 		 619 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.33 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 669 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1825  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.53 
 
 		 339 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  34.85 
 
 		 550 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  31.63 
 
 		 611 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.92 
 
 		 317 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  33.33 
 
 		 539 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  36 
 
 		 549 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  34.76 
 
 		 547 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  31.31 
 
 		 611 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  31.98 
 
 		 578 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.26 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  32.82 
 
 		 549 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  33.33 
 
 		 565 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  33.02 
 
 		 557 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  32.02 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  31.7 
 
 		 611 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.59 
 
 		 322 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31.16 
 
 		 333 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4212  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  31.63 
 
 		 326 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  33.17 
 
 		 308 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.21 
 
 		 566 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 486 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  32.29 
 
 		 561 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  32.04 
 
 		 585 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  31.58 
 
 		 536 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.67 
 
 		 623 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4535  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  33.67 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  34.69 
 
 		 625 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.63 
 
 		 617 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  37.43 
 
 		 212 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 		 320 aa  104  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 354 aa  104  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  31.63 
 
 		 615 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6140  ABC transporter related  31.51 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.620446  hitchhiker  0.00957092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  34.05 
 
 		 516 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.67 
 
 		 633 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  30.45 
 
 		 597 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  29.36 
 
 		 572 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.16 
 
 		 454 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 		 633 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  33.04 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  31.5 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31.73 
 
 		 568 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3302  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.67 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  33.03 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  32.33 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  34.36 
 
 		 575 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  30.61 
 
 		 611 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  32.33 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.11 
 
 		 323 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3460  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.2 
 
 		 317 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.735772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1665  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.81 
 
 		 325 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  29.77 
 
 		 308 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.16 
 
 		 478 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.94 
 
 		 336 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  32.38 
 
 		 593 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  30.61 
 
 		 612 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2392  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.066682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.77 
 
 		 388 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.34 
 
 		 307 aa  101  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  34.43 
 
 		 532 aa  101  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0417  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.63 
 
 		 327 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777417  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0892  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.98 
 
 		 328 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.915711  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7536  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.99 
 
 		 325 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  29.82 
 
 		 308 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>