More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0115 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  100 
 
 		 208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  52.43 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4496  ABC transporter related protein  51.5 
 
 		 204 aa  187  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  43 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03970  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  46.49 
 
 		 228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.153637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  35.71 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  32.65 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.347977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2514  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 		 406 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.883804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  35.78 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21840  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.78 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908882  normal  0.0444961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  33.51 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  39.09 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 		 426 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  36.24 
 
 		 250 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  31.44 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  35.64 
 
 		 575 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  36.36 
 
 		 572 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  39.11 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  37.68 
 
 		 258 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  34.69 
 
 		 543 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 572 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2108  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.89 
 
 		 600 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  38.65 
 
 		 542 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  38.65 
 
 		 542 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  35.53 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.83 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  36.14 
 
 		 557 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.11 
 
 		 273 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  34.24 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 		 486 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  35.64 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.18 
 
 		 337 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  34.18 
 
 		 543 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 		 347 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.2 
 
 		 332 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  34.9 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1950  oligopeptide transport ATP-binding protein F  34.18 
 
 		 330 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1324  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 		 337 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1573  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 		 337 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238612  normal  0.0236342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 		 338 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2028  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.97327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.42 
 
 		 307 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  38.16 
 
 		 542 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0204  ABC transporter related  37.57 
 
 		 307 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  36.6 
 
 		 557 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 543 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0613  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  38.1 
 
 		 533 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 		 343 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.752821  normal  0.689608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3672  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 305 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0636  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 322 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 		 370 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  34.18 
 
 		 543 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1763  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  30.1 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1134  ABC transporter related  35.16 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2912  ABC transporter-related protein  35.53 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.421482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  36 
 
 		 531 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1885  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  38.62 
 
 		 333 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  0.740268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  38.31 
 
 		 544 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2398  ABC transporter related  39.06 
 
 		 310 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  40.23 
 
 		 258 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  32.47 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  36.41 
 
 		 555 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.04 
 
 		 578 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  34.63 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.42 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.787824  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.47 
 
 		 339 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.27 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.08 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  34.72 
 
 		 336 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 		 366 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6006  ABC transporter related  37.02 
 
 		 257 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  36 
 
 		 307 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  34.1 
 
 		 271 aa  105  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  38.46 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  34.63 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02945  hypothetical protein  33.5 
 
 		 336 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 		 337 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3117  ABC type ATPase  34.43 
 
 		 331 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0682716 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5788  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.68 
 
 		 328 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.78 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  33.81 
 
 		 536 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.13 
 
 		 338 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  32.64 
 
 		 545 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002963  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  33 
 
 		 331 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  35.71 
 
 		 553 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1950  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 334 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 		 571 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  36.41 
 
 		 561 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  36.79 
 
 		 531 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.78 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.78 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0816  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 		 346 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  36.59 
 
 		 670 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>