More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4496 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4496  ABC transporter related protein  100 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  55.15 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  51.5 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  42.16 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03970  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  38.28 
 
 		 228 aa  121  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.153637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  38.68 
 
 		 575 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  36.67 
 
 		 536 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.26 
 
 		 308 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.26 
 
 		 308 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1568  putative ABC transport system ATP-binding protein  36.26 
 
 		 308 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2095  putative ABC transport system ATP-binding protein  36.26 
 
 		 308 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.14 
 
 		 566 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1672  putative ABC transport system ATP-binding protein  36.61 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01441  D-ala-D-ala transporter subunit  35.71 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2597  ABC transporter  35.53 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0185362 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01453  hypothetical protein  35.71 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.113501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1746  putative ABC transport system ATP-binding protein  35.71 
 
 		 308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.375505  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 554 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  36.89 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  33.18 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1690  putative ABC transport system ATP-binding protein  35.71 
 
 		 308 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.560594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  31.43 
 
 		 254 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  35.75 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  35.18 
 
 		 555 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  40.51 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  33.17 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.81 
 
 		 273 aa  107  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  41 
 
 		 518 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.347977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  34.11 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  40 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0204  ABC transporter related  32.65 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5586  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 		 511 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249808  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  29.5 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  35.1 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1333  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.15 
 
 		 343 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0359  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.17 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000171313  hitchhiker  0.000153008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  29.95 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  31.84 
 
 		 613 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  33.49 
 
 		 686 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  38 
 
 		 613 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  37.5 
 
 		 557 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3166  ABC transporter related  34.67 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.631435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  33.33 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  37.3 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0670  ABC transporter related  32.38 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0816  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 		 346 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  39.38 
 
 		 340 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2351  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  31.13 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 261 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  35.62 
 
 		 264 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  32.1 
 
 		 686 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  34.01 
 
 		 308 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  36.68 
 
 		 557 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3078  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.85 
 
 		 338 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3139  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.42 
 
 		 321 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  33.18 
 
 		 573 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.58 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 		 546 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  39.27 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  30 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 337 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  35.1 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  31.22 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  37.37 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.97 
 
 		 597 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  32.72 
 
 		 583 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.73 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  29.03 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0167  hypothetical protein  30.65 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  38.07 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1885  oligopeptide ATP-binding ABC transporter protein  41.12 
 
 		 333 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  0.740268 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  29.59 
 
 		 530 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  32.72 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3033  ABC peptide/opine transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 333 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  32.08 
 
 		 256 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31.86 
 
 		 568 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 256 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  29.59 
 
 		 530 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3760  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27830  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.91 
 
 		 298 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.95 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.56 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  38.17 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  36.19 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  35.71 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.3 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  33.82 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  39.09 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  33.67 
 
 		 549 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>