197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0847 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  100 
 
 
516 aa  1077    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  40.37 
 
 
554 aa  382  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  39.89 
 
 
519 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  35.29 
 
 
494 aa  305  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  33.27 
 
 
505 aa  293  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  35.29 
 
 
494 aa  289  9e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  33.72 
 
 
493 aa  289  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  35.17 
 
 
494 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  37.74 
 
 
480 aa  287  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  35.98 
 
 
496 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  35.8 
 
 
509 aa  266  7e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  33.58 
 
 
495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  32.7 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  31.57 
 
 
496 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  31.57 
 
 
496 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  32.35 
 
 
506 aa  243  7e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  35.59 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  31.4 
 
 
470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  33.64 
 
 
518 aa  239  9e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  32.19 
 
 
496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  32.95 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  31.63 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  32.91 
 
 
505 aa  233  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  33.94 
 
 
505 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  32.19 
 
 
508 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  31.1 
 
 
482 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  33.14 
 
 
492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  33.46 
 
 
505 aa  223  7e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  30.97 
 
 
481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  29.34 
 
 
515 aa  218  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  31.03 
 
 
488 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  33.02 
 
 
510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  31.14 
 
 
512 aa  216  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  29.93 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  31.14 
 
 
512 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  32.79 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  31.34 
 
 
475 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  31.06 
 
 
474 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  30.25 
 
 
514 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  32.06 
 
 
491 aa  209  9e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  30.43 
 
 
514 aa  206  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  32.15 
 
 
505 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  35.04 
 
 
510 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  30.45 
 
 
499 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  32.7 
 
 
492 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  30.55 
 
 
514 aa  199  9e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  29.57 
 
 
473 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  31.57 
 
 
523 aa  190  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  31.9 
 
 
497 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  29.57 
 
 
515 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  29.38 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  33.72 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  28.98 
 
 
500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  29.09 
 
 
490 aa  144  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  28.57 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  29.59 
 
 
480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  42.54 
 
 
149 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  25.56 
 
 
429 aa  113  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  39.85 
 
 
153 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.07 
 
 
352 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  26.3 
 
 
455 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  26.3 
 
 
455 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  26.61 
 
 
455 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  24.7 
 
 
550 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  24.95 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  25.7 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  25.7 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  27.69 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  48.86 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  26.69 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  25.37 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  23.83 
 
 
463 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  26.73 
 
 
458 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  25.65 
 
 
507 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  27.72 
 
 
1069 aa  64.3  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  27.32 
 
 
1070 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.85 
 
 
640 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  27.1 
 
 
488 aa  63.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.85 
 
 
640 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  24.44 
 
 
399 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.9 
 
 
640 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  23.27 
 
 
489 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  24.27 
 
 
445 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  25.36 
 
 
472 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  25.44 
 
 
532 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  25.44 
 
 
532 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28 
 
 
491 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.44 
 
 
532 aa  54.3  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.49 
 
 
474 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.83 
 
 
484 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  34.33 
 
 
211 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
171 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.91 
 
 
171 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  32.47 
 
 
200 aa  47.4  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.46 
 
 
177 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1521  NADH dehydrogenase subunit I  35.48 
 
 
231 aa  47  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00088837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  32.73 
 
 
164 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  32.73 
 
 
164 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 
170 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>