93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1528 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  100 
 
 		 469 aa  985    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  40.84 
 
 		 518 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  41.29 
 
 		 505 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  41.68 
 
 		 505 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  40.51 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  40.23 
 
 		 509 aa  335  9e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  42.14 
 
 		 505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  40.08 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  36.95 
 
 		 496 aa  300  5e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  36.95 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  40.54 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  34.96 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  34.96 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  34.71 
 
 		 494 aa  273  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  36.83 
 
 		 508 aa  272  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  34.57 
 
 		 494 aa  272  9e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  36.8 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  36.74 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  35.51 
 
 		 507 aa  266  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  35.88 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  35.88 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  35.09 
 
 		 506 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  34.17 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  33.66 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  36.34 
 
 		 482 aa  254  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  35.25 
 
 		 499 aa  253  6e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  34.81 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  35.69 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  34.96 
 
 		 491 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  34.07 
 
 		 481 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  36.29 
 
 		 496 aa  249  9e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  35.1 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  34.43 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  37.11 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  35.59 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  35.62 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  34.29 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  36.56 
 
 		 510 aa  237  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  33.4 
 
 		 492 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  33.4 
 
 		 470 aa  232  9e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  32.71 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  32.42 
 
 		 515 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  33.27 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  33.07 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  33.93 
 
 		 488 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  34.76 
 
 		 523 aa  216  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  33.15 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  34.4 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  34.23 
 
 		 497 aa  212  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  34.02 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  32.11 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  31.74 
 
 		 523 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  32.7 
 
 		 515 aa  202  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  30.69 
 
 		 554 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  30.41 
 
 		 490 aa  161  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  27.25 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  43.4 
 
 		 149 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  27.73 
 
 		 429 aa  143  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  35.76 
 
 		 153 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  43.39 
 
 		 214 aa  96.7  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  25.98 
 
 		 352 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  24.91 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  24.58 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  25 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  31.16 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  26.01 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  32.57 
 
 		 488 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  26.64 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  26.92 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  28.85 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  25.23 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  28.21 
 
 		 1069 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  25.24 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  23.42 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  28.23 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  25.16 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  23.78 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  27.35 
 
 		 1070 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  28.98 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  25.97 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  31.66 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.27 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.38 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.4 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.97 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.21 
 
 		 640 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.21 
 
 		 640 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  29.38 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  29.38 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 282 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  28.4 
 
 		 374 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  30.39 
 
 		 531 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>