90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1291 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  100 
 
 		 519 aa  1079    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  39.89 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  37.23 
 
 		 554 aa  294  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  35.38 
 
 		 493 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  33.76 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  35.65 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  33.96 
 
 		 494 aa  264  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  35.26 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  35.28 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  33.84 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  33.84 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  34.45 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  34.59 
 
 		 495 aa  246  6e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  37.66 
 
 		 507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  33.83 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  31.35 
 
 		 492 aa  239  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  33.16 
 
 		 506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  34.03 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  36.04 
 
 		 508 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  31.99 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  32.02 
 
 		 509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  29.29 
 
 		 481 aa  217  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  31.21 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  32.28 
 
 		 475 aa  216  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  33.15 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  33.03 
 
 		 505 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  32.33 
 
 		 480 aa  213  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  31.17 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  32.84 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  32.31 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  28.86 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  31.16 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  32.12 
 
 		 473 aa  206  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  31.82 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  31.48 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  28.63 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  30.76 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  33.33 
 
 		 505 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  32.41 
 
 		 491 aa  204  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  31.78 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  30.25 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  31.58 
 
 		 514 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  29.07 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  28.67 
 
 		 512 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  31.49 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  32.18 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  30.6 
 
 		 497 aa  194  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  30.36 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  32 
 
 		 523 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  30.84 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  31.91 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  31.8 
 
 		 515 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  31.17 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  29.55 
 
 		 473 aa  177  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  28.12 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  25.67 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  42.95 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  23.2 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  27.06 
 
 		 352 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  32.68 
 
 		 153 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  28.38 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  36.53 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  27.11 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  27.98 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  33.54 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  27.31 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  24.52 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  23.85 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  23.05 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  27.78 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  24.44 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  27.78 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  24.44 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  31.68 
 
 		 489 aa  67  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  25.1 
 
 		 1070 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  26.27 
 
 		 1069 aa  66.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.27 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  27.14 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  29.79 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  32.17 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.03 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.49 
 
 		 484 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  24.27 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  26.9 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  26.7 
 
 		 474 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  24.1 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.28 
 
 		 640 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.34 
 
 		 640 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.34 
 
 		 640 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>