116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1344 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  100 
 
 		 488 aa  1016    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  43.8 
 
 		 470 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  43.2 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  43.03 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  38.4 
 
 		 512 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  38.4 
 
 		 512 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  33.33 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  34.93 
 
 		 496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  32.95 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  34.93 
 
 		 496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  34.19 
 
 		 496 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  31.63 
 
 		 493 aa  220  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  32.89 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  31.54 
 
 		 482 aa  216  8e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  30.31 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  32.31 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  29.82 
 
 		 474 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  32.09 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  32.46 
 
 		 505 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  32.82 
 
 		 505 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  32.4 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  31.26 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  31.27 
 
 		 509 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  30.96 
 
 		 499 aa  203  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  27.92 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  30.96 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  30.16 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  30.28 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  30.94 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  29.98 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  30.04 
 
 		 494 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  28.99 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  29.04 
 
 		 495 aa  194  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  28.85 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  29.68 
 
 		 491 aa  189  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  30.78 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  26.26 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  30.41 
 
 		 514 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  30.04 
 
 		 514 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  27 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  30.66 
 
 		 490 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  30.53 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  28.6 
 
 		 508 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  28.84 
 
 		 507 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  28.85 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  30.36 
 
 		 505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  28.3 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  29.33 
 
 		 523 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  32.23 
 
 		 506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  29.17 
 
 		 497 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  25.95 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  28.76 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  28.99 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  28.73 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  28.12 
 
 		 499 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  27.09 
 
 		 480 aa  153  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  26.15 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  38.22 
 
 		 153 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  44.06 
 
 		 149 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  28.44 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  28.66 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.35 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  28.44 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  28.26 
 
 		 514 aa  97.4  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  31.37 
 
 		 550 aa  97.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  28.04 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  27.83 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  36.61 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  30.48 
 
 		 488 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  34.05 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  33.67 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  24.52 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  29.77 
 
 		 445 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  27.36 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.14 
 
 		 532 aa  79.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.05 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  31.29 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  31.29 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  28.37 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  27.91 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  31.28 
 
 		 1070 aa  70.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.73 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.21 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  28.16 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  26.73 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  30.73 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  30.81 
 
 		 1069 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.36 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.36 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25 
 
 		 640 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23.5 
 
 		 380 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.33 
 
 		 367 aa  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  28.37 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  23 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  22.45 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  26.21 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  23 
 
 		 380 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  23 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>