100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1327 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  100 
 
 		 499 aa  1043    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  46.73 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  47.6 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  46.54 
 
 		 514 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  40.73 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  41.68 
 
 		 523 aa  336  5e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  41.31 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  39.64 
 
 		 481 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  38.58 
 
 		 510 aa  326  6e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  37.81 
 
 		 499 aa  323  6e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  37.65 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  39.5 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  35.88 
 
 		 492 aa  307  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  37.6 
 
 		 492 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  35.29 
 
 		 523 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  35.29 
 
 		 500 aa  256  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  33.2 
 
 		 482 aa  254  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  33.84 
 
 		 496 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  33.65 
 
 		 509 aa  220  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  33.27 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  33.27 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  31.43 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  34.13 
 
 		 490 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  31.76 
 
 		 474 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  30.13 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  31.68 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  32.04 
 
 		 493 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  30.58 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  34.02 
 
 		 469 aa  204  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  29.7 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  32.22 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  32.08 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  32.47 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  31.17 
 
 		 515 aa  197  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  32.5 
 
 		 496 aa  196  9e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  32.3 
 
 		 473 aa  193  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  33.81 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  32.95 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  32.12 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  30.36 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  31.93 
 
 		 495 aa  186  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  31.58 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  31.91 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  31.41 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  30.5 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  32.45 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  30.04 
 
 		 505 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  30.06 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  29.87 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  29.38 
 
 		 516 aa  173  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  29.04 
 
 		 488 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  29.77 
 
 		 554 aa  170  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  29.49 
 
 		 518 aa  170  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  30.38 
 
 		 509 aa  169  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  30.56 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  28.29 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  28.81 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  25.4 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  32.09 
 
 		 463 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  27.73 
 
 		 550 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  38.41 
 
 		 153 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.05 
 
 		 352 aa  90.9  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  25.32 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  28.64 
 
 		 445 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  33.33 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.99 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  23.61 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.68 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.82 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  33.33 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  32.97 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  32.97 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  25.25 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  26.09 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  26.09 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  34.65 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  24.59 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  24.59 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  24.07 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  28.9 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.42 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  29.07 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  25.08 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  25.73 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  30.54 
 
 		 1069 aa  64.3  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  27.68 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.59 
 
 		 640 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.59 
 
 		 640 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  27.27 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  28.91 
 
 		 367 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  21.54 
 
 		 640 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.7 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  24.24 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  23.39 
 
 		 331 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.69 
 
 		 374 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  27.5 
 
 		 379 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  28.79 
 
 		 355 aa  44.3  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  25.15 
 
 		 379 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0255  iron-sulfur cluster-binding protein  27.59 
 
 		 320 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>