120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0296 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  100 
 
 
512 aa  1075    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  99.41 
 
 
512 aa  1071    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  41.34 
 
 
470 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  40.63 
 
 
470 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  39.16 
 
 
488 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  40.32 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  32.95 
 
 
482 aa  243  9e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  34.1 
 
 
510 aa  233  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  33.08 
 
 
496 aa  232  9e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  33.08 
 
 
496 aa  232  9e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  31.89 
 
 
481 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  30.4 
 
 
496 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  31.94 
 
 
499 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  30.34 
 
 
509 aa  224  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  31.51 
 
 
492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  30.46 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  32.96 
 
 
518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  33.15 
 
 
514 aa  221  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  33.66 
 
 
505 aa  220  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  33.27 
 
 
469 aa  219  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  33.21 
 
 
475 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  33.46 
 
 
496 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  30.35 
 
 
493 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  32.97 
 
 
514 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  31.21 
 
 
480 aa  217  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  31.19 
 
 
494 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  33.89 
 
 
514 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  33.14 
 
 
523 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  32.63 
 
 
509 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  31 
 
 
506 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  32.7 
 
 
523 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  31.14 
 
 
516 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  32.65 
 
 
505 aa  206  8e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  32.88 
 
 
473 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  28.26 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  30.52 
 
 
494 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  31.39 
 
 
505 aa  196  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  29.98 
 
 
474 aa  196  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  32.3 
 
 
497 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  29.83 
 
 
494 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  33.52 
 
 
492 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  30.31 
 
 
523 aa  190  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  28.32 
 
 
519 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  31.23 
 
 
508 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  31.66 
 
 
491 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  30.86 
 
 
490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  30.35 
 
 
507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  29.31 
 
 
500 aa  182  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  33.02 
 
 
505 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  30.43 
 
 
495 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  29.61 
 
 
554 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  30.17 
 
 
510 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  35.09 
 
 
495 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  30.06 
 
 
499 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  26.9 
 
 
515 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  27.74 
 
 
480 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  26.45 
 
 
429 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  27.3 
 
 
352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  39.24 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  25.52 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  26.28 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  26.13 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  41.96 
 
 
149 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  24.85 
 
 
461 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  30.92 
 
 
458 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  29.49 
 
 
514 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  29.49 
 
 
514 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  28.71 
 
 
488 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  29.86 
 
 
445 aa  90.1  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  30.95 
 
 
550 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  25.48 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  24.53 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  29.65 
 
 
345 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  30.62 
 
 
489 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  30.3 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  30.3 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.74 
 
 
640 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  22.74 
 
 
640 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  32.09 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.15 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  27.56 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.75 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  33.5 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.8 
 
 
484 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.29 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.46 
 
 
640 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  29.95 
 
 
1069 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  30.12 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  30.05 
 
 
1070 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  22.1 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.2 
 
 
263 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  29.52 
 
 
380 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  29.52 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.61 
 
 
380 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.61 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  29.59 
 
 
380 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  29.59 
 
 
380 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.59 
 
 
380 aa  53.5  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.59 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  29.59 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>