126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0079 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  100 
 
 
554 aa  1160    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  41.1 
 
 
516 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  37.23 
 
 
519 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  31.82 
 
 
493 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  32.22 
 
 
496 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  32.22 
 
 
496 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  31.31 
 
 
505 aa  250  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  29.93 
 
 
494 aa  241  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  31.82 
 
 
506 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  31.87 
 
 
496 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  30.69 
 
 
496 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  31.32 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  31.37 
 
 
495 aa  234  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  31.12 
 
 
495 aa  233  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  30.43 
 
 
509 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  30.73 
 
 
494 aa  229  9e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  30.82 
 
 
482 aa  220  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  31.24 
 
 
480 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  29.1 
 
 
515 aa  203  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  29.27 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  30.28 
 
 
492 aa  200  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  31.96 
 
 
507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  29.26 
 
 
509 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  29.6 
 
 
469 aa  194  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  28.42 
 
 
470 aa  194  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  31.44 
 
 
508 aa  192  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  29.58 
 
 
514 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  29.57 
 
 
488 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  29.96 
 
 
512 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  30.84 
 
 
523 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  29.79 
 
 
512 aa  187  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  29.82 
 
 
514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  29.35 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  29.48 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  28.57 
 
 
518 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  30.31 
 
 
523 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  29.91 
 
 
515 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  28.33 
 
 
505 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  29.02 
 
 
492 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  30.51 
 
 
473 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  29.34 
 
 
505 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  27.89 
 
 
474 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  29.27 
 
 
514 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  29.32 
 
 
499 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  29.02 
 
 
505 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  28.02 
 
 
497 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  28.7 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  27.45 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  31.58 
 
 
470 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  32.58 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  26.9 
 
 
505 aa  153  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  31.55 
 
 
481 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  53.19 
 
 
149 aa  143  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  25.43 
 
 
490 aa  136  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  32.23 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  32.32 
 
 
500 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  45.77 
 
 
153 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  25.7 
 
 
429 aa  117  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  35.16 
 
 
345 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  24.12 
 
 
480 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  30.29 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  26.3 
 
 
550 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  22.19 
 
 
514 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  22.31 
 
 
514 aa  92  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  24.86 
 
 
352 aa  90.1  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  31.64 
 
 
532 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  31.64 
 
 
532 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  32.12 
 
 
445 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  25.94 
 
 
489 aa  87.8  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  31.22 
 
 
488 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  29.74 
 
 
458 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.64 
 
 
532 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  25.22 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  30.57 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  32.32 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  34.01 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  34.01 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  34.69 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  29.57 
 
 
474 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  28.07 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  31.15 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.87 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  26.79 
 
 
1069 aa  66.6  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.87 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.45 
 
 
474 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  28.85 
 
 
1070 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.03 
 
 
640 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.01 
 
 
640 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.01 
 
 
640 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  32.99 
 
 
488 aa  54.3  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.65 
 
 
288 aa  54.3  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  28.77 
 
 
398 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  34.04 
 
 
484 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  31.91 
 
 
508 aa  53.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  42.55 
 
 
214 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  31.37 
 
 
485 aa  51.6  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  39.44 
 
 
597 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  35.53 
 
 
184 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  29.29 
 
 
531 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  23.18 
 
 
364 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>