107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0173 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  100 
 
 		 510 aa  1068    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  50 
 
 		 510 aa  500  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  44.59 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  45.42 
 
 		 514 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  47.01 
 
 		 497 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  46.14 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  45.61 
 
 		 514 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  45.79 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  44.62 
 
 		 523 aa  418  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  44.81 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  43.5 
 
 		 475 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  42.86 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  43.05 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  39.14 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  39.31 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  39.12 
 
 		 523 aa  323  4e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  37.28 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  34.44 
 
 		 515 aa  269  7e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  35.2 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  34.21 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  36.56 
 
 		 469 aa  251  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  33.4 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  33.46 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  33.83 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  33.71 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  33.77 
 
 		 470 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  33.71 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  34.89 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  30.89 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  31.2 
 
 		 494 aa  233  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  34.46 
 
 		 507 aa  232  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  33.64 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  33.21 
 
 		 473 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  34.52 
 
 		 508 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  33.59 
 
 		 496 aa  223  8e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  35.04 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  32.75 
 
 		 490 aa  217  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  32.84 
 
 		 519 aa  216  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  33.21 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  33.73 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  32.63 
 
 		 518 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  30.96 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  30.47 
 
 		 494 aa  210  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  31.64 
 
 		 505 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  30.63 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  32.16 
 
 		 505 aa  207  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  31.94 
 
 		 506 aa  206  8e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  32.27 
 
 		 473 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  31.14 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  29.85 
 
 		 512 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  30.17 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  33.52 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  33.52 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  32.2 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  29.85 
 
 		 488 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  30.28 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  28.5 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  43.48 
 
 		 214 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  37.16 
 
 		 149 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  26.32 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  25.07 
 
 		 458 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  32.48 
 
 		 153 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  25.42 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  27.64 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  25.39 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  23.3 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  26.79 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  28.13 
 
 		 514 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  25.57 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.38 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  25.05 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  27.4 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  26.63 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  30.39 
 
 		 472 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  27.05 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  25.18 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  33.61 
 
 		 1069 aa  67.4  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  26.8 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  26.59 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  29.44 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  26.64 
 
 		 1070 aa  64.7  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  27.78 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  27.78 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.78 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.25 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.11 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.25 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.86 
 
 		 640 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.86 
 
 		 640 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.37 
 
 		 640 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.86 
 
 		 374 aa  50.4  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  24.63 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1404  iron-sulfur cluster-binding protein  23.63 
 
 		 308 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  35.62 
 
 		 389 aa  47  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  34.25 
 
 		 380 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  34.85 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.85 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  29.23 
 
 		 311 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.85 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>