95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1393 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  100 
 
 		 495 aa  1033    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  94.55 
 
 		 495 aa  960    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  50.1 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  45.53 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  45.73 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  46.92 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  47.2 
 
 		 494 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  46.8 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  44.2 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  43.75 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  44.05 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  39.7 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  40.77 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  39.06 
 
 		 496 aa  336  7e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  39.06 
 
 		 496 aa  336  7e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  38.19 
 
 		 496 aa  317  4e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  37.25 
 
 		 480 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  34.81 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  35.02 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  32.7 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  32.49 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  34.81 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  33.33 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  34.66 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  32.89 
 
 		 515 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  33.83 
 
 		 519 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  33.02 
 
 		 505 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  35.75 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  33.07 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  34.8 
 
 		 514 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  31.31 
 
 		 554 aa  233  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  32.66 
 
 		 470 aa  233  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  31.36 
 
 		 482 aa  230  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  33.27 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  33.98 
 
 		 473 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  34.17 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  34.24 
 
 		 514 aa  226  9e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  31.2 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  31.58 
 
 		 473 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  32.72 
 
 		 515 aa  217  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  31.67 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  31.01 
 
 		 481 aa  213  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  30.19 
 
 		 488 aa  213  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  29.33 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  32.6 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  33.6 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  32.41 
 
 		 523 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  32.63 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  32.06 
 
 		 523 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  31.74 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  30.75 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  31.8 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  32.56 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  30.43 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  31.41 
 
 		 499 aa  183  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  51.88 
 
 		 149 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  25.71 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  25.54 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  39.44 
 
 		 153 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.46 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  27.84 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  27.84 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  27.84 
 
 		 455 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  30.52 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  30.38 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  28.93 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  29.6 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  25.91 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  28.33 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  27.04 
 
 		 550 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  29.74 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  29.29 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  26.32 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  27.2 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  26.78 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  27.43 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  31.05 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  31.3 
 
 		 1069 aa  70.5  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  32.82 
 
 		 1070 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  31.05 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.73 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.73 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.55 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.66 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.45 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  27.74 
 
 		 532 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  27.74 
 
 		 532 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 		 263 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  34.25 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.93 
 
 		 597 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.77 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>