93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0104 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  100 
 
 		 515 aa  1080    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  93.59 
 
 		 515 aa  1027    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  34.83 
 
 		 482 aa  292  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  36.05 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  33.07 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  33.33 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  32.88 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  32.23 
 
 		 494 aa  247  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  34.32 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  33.52 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  32.96 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  33.27 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  31.72 
 
 		 492 aa  240  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  32.28 
 
 		 505 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  35.2 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  33.4 
 
 		 475 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  31.61 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  33.01 
 
 		 494 aa  229  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  33.76 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  32.84 
 
 		 507 aa  227  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  32.61 
 
 		 508 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  31.84 
 
 		 523 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  33.2 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  31.84 
 
 		 523 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  29.92 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  30.38 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  32.72 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  33.21 
 
 		 492 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  32.59 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  33.4 
 
 		 509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  32.53 
 
 		 495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  30.44 
 
 		 505 aa  210  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  30.84 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  30.38 
 
 		 506 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  30.27 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  32.7 
 
 		 469 aa  204  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  27.95 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  30.77 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  31.21 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  30.87 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  32.44 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  29.48 
 
 		 523 aa  193  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  29.57 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  31.75 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  32.07 
 
 		 505 aa  191  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  31.8 
 
 		 519 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  28.52 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  28.52 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  31.58 
 
 		 497 aa  183  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  29.73 
 
 		 554 aa  183  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  32.38 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  27.34 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  29.59 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  27.21 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  29.65 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  30.26 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  28.44 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  25.57 
 
 		 352 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  29.22 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  30.84 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  30.84 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  35.67 
 
 		 153 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  25.95 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  31.44 
 
 		 550 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  25.54 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  28.08 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  27.39 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  29.49 
 
 		 455 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  27.35 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  26.22 
 
 		 463 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  34.12 
 
 		 345 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  34.29 
 
 		 214 aa  87  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  27.56 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  32.45 
 
 		 149 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  23.64 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.39 
 
 		 640 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.39 
 
 		 640 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.91 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  28.51 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  29.78 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  24.39 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  29.15 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  22.99 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  27.88 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.58 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.75 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.34 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  30.95 
 
 		 1069 aa  57.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  29.37 
 
 		 1070 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  28.99 
 
 		 259 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.09 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  23.94 
 
 		 364 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>