118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0876 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  100 
 
 
510 aa  1068    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  50.28 
 
 
514 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  49.91 
 
 
514 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  50.47 
 
 
514 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  50 
 
 
510 aa  480  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  47.1 
 
 
523 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  47.49 
 
 
523 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  48.54 
 
 
497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  45.51 
 
 
499 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  43.66 
 
 
481 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  43.3 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  43.37 
 
 
475 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  42.58 
 
 
492 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  41.33 
 
 
500 aa  360  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  40.95 
 
 
499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  40.55 
 
 
523 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  36.2 
 
 
482 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  35.57 
 
 
496 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  35.38 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  33.96 
 
 
470 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  35.67 
 
 
480 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  33.02 
 
 
515 aa  259  6e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  33.67 
 
 
474 aa  259  8e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  32.45 
 
 
470 aa  257  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  32.36 
 
 
505 aa  256  8e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  33.92 
 
 
490 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  30.24 
 
 
494 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  34.43 
 
 
469 aa  240  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  32.96 
 
 
515 aa  237  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  34.29 
 
 
512 aa  236  8e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  34.1 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  31.84 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  31.84 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  31.12 
 
 
507 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  29.76 
 
 
493 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  34.11 
 
 
473 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  29.68 
 
 
494 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  35.94 
 
 
505 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  30.09 
 
 
494 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  30.6 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  32.38 
 
 
473 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  31.2 
 
 
495 aa  217  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  32.88 
 
 
518 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  32.29 
 
 
505 aa  216  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  32.25 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  31.2 
 
 
495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  33.02 
 
 
516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  31.43 
 
 
509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  32.49 
 
 
505 aa  213  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  31.04 
 
 
505 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  29.72 
 
 
488 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  32.77 
 
 
491 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  30.26 
 
 
506 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  31.48 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  31.66 
 
 
480 aa  193  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  29.48 
 
 
554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  29.18 
 
 
429 aa  177  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  44.1 
 
 
214 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  39.33 
 
 
153 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  39.6 
 
 
149 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  25.21 
 
 
488 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  27.49 
 
 
352 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  23.62 
 
 
489 aa  97.4  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  28.57 
 
 
445 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  23.32 
 
 
468 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  26.12 
 
 
463 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  27.52 
 
 
458 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  25.08 
 
 
550 aa  87.4  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  28.96 
 
 
532 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  28.89 
 
 
532 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  22.43 
 
 
514 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  24.61 
 
 
455 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  30.99 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  25.26 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  29.7 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  22.06 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.89 
 
 
532 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  23.81 
 
 
455 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  23.41 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  24.11 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.68 
 
 
491 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.72 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  26.2 
 
 
461 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.32 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  30.67 
 
 
1069 aa  64.3  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  30.48 
 
 
507 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.83 
 
 
640 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.83 
 
 
640 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  24.15 
 
 
640 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  27.06 
 
 
1070 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  38.78 
 
 
363 aa  54.7  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  39.73 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  26.23 
 
 
312 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  38.36 
 
 
380 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  40.58 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.49 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  28.49 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  28.49 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.49 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.49 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>