92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1522 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  61.81 
 
 		 496 aa  657    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  61.42 
 
 		 509 aa  653    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  85.27 
 
 		 508 aa  893    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  100 
 
 		 507 aa  1063    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  54.6 
 
 		 494 aa  554  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  54.6 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  55.19 
 
 		 494 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  52.46 
 
 		 493 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  42.97 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  43.75 
 
 		 495 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  43.36 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  38.52 
 
 		 496 aa  339  9e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  38.52 
 
 		 496 aa  339  9e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  38.96 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  38.88 
 
 		 506 aa  312  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  37.6 
 
 		 480 aa  295  9e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  35.46 
 
 		 491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  34.24 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  35.51 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  33.66 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  36.76 
 
 		 514 aa  253  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  35.23 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1320  reductive dehalogenase  34.81 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  35.04 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  37.66 
 
 		 519 aa  247  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  35.58 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  34.05 
 
 		 505 aa  246  8e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  33.33 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  34.48 
 
 		 492 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  31.57 
 
 		 481 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  35.09 
 
 		 514 aa  239  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  35.64 
 
 		 514 aa  239  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  32.89 
 
 		 516 aa  236  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  33.8 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  30.94 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  33.27 
 
 		 499 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  32.84 
 
 		 515 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  33.33 
 
 		 505 aa  224  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  31.59 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  34.46 
 
 		 510 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  32.01 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  32.35 
 
 		 523 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  32.22 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  32.83 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  32.02 
 
 		 500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  33.02 
 
 		 497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  31.96 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  29.61 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  29.57 
 
 		 488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  30.75 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  30.16 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  30.61 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  28.62 
 
 		 470 aa  193  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  29.31 
 
 		 523 aa  190  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  31.61 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1308  reductive dehalogenase  51.11 
 
 		 149 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  25.41 
 
 		 480 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  25.18 
 
 		 429 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  42.03 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.36 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1302  hypothetical protein  37.17 
 
 		 214 aa  94.4  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  26.38 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  26.38 
 
 		 455 aa  94.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  26.06 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  26.69 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  26.96 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  28.91 
 
 		 458 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  31 
 
 		 488 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  29.79 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  31.71 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.65 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  27.13 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.12 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.12 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23 
 
 		 640 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.33 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.33 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  26.97 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  26.51 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  25.33 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  25.33 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  25.81 
 
 		 1069 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  26.35 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  27.42 
 
 		 1070 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  27.8 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  27.09 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  26.7 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 532 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  27.43 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  27.43 
 
 		 532 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  30.14 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.62 
 
 		 376 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>