More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1820 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
211 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0146  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.85 
 
 
204 aa  290  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00110619  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  58.85 
 
 
213 aa  232  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  58.85 
 
 
213 aa  232  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  58.85 
 
 
213 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1437  NADH dehydrogenase subunit I  55.73 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1521  NADH dehydrogenase subunit I  53.93 
 
 
231 aa  218  7e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00088837  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  53.12 
 
 
200 aa  217  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1664  NADH dehydrogenase subunit I  46.03 
 
 
212 aa  185  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.910659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  38.17 
 
 
224 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  35.62 
 
 
167 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
162 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
273 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  35.92 
 
 
163 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.26 
 
 
177 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  35.62 
 
 
177 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
164 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
167 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
167 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
169 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  34.53 
 
 
164 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  34.48 
 
 
161 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  37.7 
 
 
161 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  36.03 
 
 
164 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  99  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
169 aa  98.2  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  37.3 
 
 
167 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  35.11 
 
 
165 aa  98.2  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
165 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  35.48 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  35.48 
 
 
169 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
170 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  32.26 
 
 
163 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  35.94 
 
 
169 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
163 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
170 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
165 aa  95.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
171 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  34.18 
 
 
163 aa  95.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.01 
 
 
165 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  35.88 
 
 
165 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
162 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.53 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 
162 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  36.64 
 
 
163 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  38.06 
 
 
163 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  36.43 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  36.23 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.01 
 
 
132 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.29 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  34.69 
 
 
163 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
163 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.59 
 
 
165 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  36.22 
 
 
132 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
163 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  37.4 
 
 
162 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.72 
 
 
162 aa  91.3  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  36.03 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  36.64 
 
 
162 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
160 aa  90.1  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  36.64 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2823  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0530625  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  36.72 
 
 
163 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  39.64 
 
 
163 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
163 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  33.08 
 
 
163 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  34.35 
 
 
163 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  38.53 
 
 
163 aa  89.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>