More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1660 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
234 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  43.54 
 
 
162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.96 
 
 
132 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.97 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  44.76 
 
 
273 aa  128  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  43.06 
 
 
162 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
169 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  45.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  39.47 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  43.92 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 
170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
163 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
163 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  38.82 
 
 
163 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  42.66 
 
 
167 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.67 
 
 
132 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  42.36 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  41.06 
 
 
163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  42.36 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  42.36 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.67 
 
 
132 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  42.55 
 
 
226 aa  125  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.74 
 
 
135 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 
163 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  44.53 
 
 
169 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 
163 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 
163 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  44.09 
 
 
132 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
163 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  41.89 
 
 
169 aa  123  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  40.82 
 
 
181 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.09 
 
 
131 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  40.51 
 
 
165 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  40.51 
 
 
167 aa  122  5e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  43.26 
 
 
163 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
163 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  44.53 
 
 
171 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  43.51 
 
 
169 aa  121  8e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  40.41 
 
 
162 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
163 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  45.11 
 
 
162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  38.82 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  37.97 
 
 
162 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
163 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
162 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
163 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  38.19 
 
 
163 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  43.88 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  41.43 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  42.34 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  38.19 
 
 
162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  41.73 
 
 
161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
162 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  40.71 
 
 
163 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  43.17 
 
 
162 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
162 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.78 
 
 
162 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.88 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  44.36 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  40.56 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
162 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 
164 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  41.73 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 
163 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
167 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
163 aa  111  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
168 aa  111  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 
163 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 
162 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 
162 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1664  NADH dehydrogenase subunit I  33.71 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.910659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>